Монокль как выбрать: Как выбрать монокуляр для охоты

Содержание

Монокуляры: что это такое и для чего они нужны

Отечественный рынок предлагает потенциальным покупателям широкий ассортимент оптических приборов. Монокуляры уже давно стали альтернативой традиционным биноклям. Давайте ознакомимся с его функциями и назначением.

Содержание

Что такое монокуляр?

Монокуляр – это простая увеличительная линза, которая в большинстве случаев имеет дополнительные электронные функции. Монокуляры больше похожи на оптические прицелы, чем на бинокли. Однако, по сравнению с оптическими прицелами, они могут иметь специальное крепление для установки на голове человека. Дизайн сделан так, чтобы его было максимально удобно носить в руке.

Характеристики

Классификация современных монокуляров аналогична классификации биноклей. В его основе лежит оптическая система. При выборе оборудования не стоит экономить на его качестве, поскольку это основной фактор, определяющий четкость получаемого изображения. Нередко с помощью монокуляра можно вести ночную стрельбу. Полная работоспособность оптической системы гарантируется электронным заполнением. Если вам необходимо делать снимки в условиях низкой освещенности или при отсутствии источника света, выбирайте модель с высокими характеристиками.

Следует понимать, что монокуляры могут использоваться для определенных целей. Большинство ночных приборов совершенно бесполезны днем. С другой стороны, модели с оптикой, предназначенной для дневной съемки, не смогут хорошо снимать ночью. На рынке также можно найти универсальные устройства, которые могут работать в любое время без каких-либо проблем. Их стоимость, конечно, выше.

Все устройства могут быть:

пассивный: Эксплуатация возможна только при минимальном или нормальном освещении в помещении;
активный: Наличие инфракрасной подсветки позволяет работать при полном отсутствии солнечного или искусственного света.

Что влияет на стоимость технологии?

Ответ на этот вопрос напрямую определяется тремя основными факторами:

Марка производителя.
Коэффициент увеличения.
Наличие дополнительной функциональности.

Последний фактор оказывает наибольшее влияние. Окончательная стоимость, как правило, варьируется в широком диапазоне значений. Если китайская модель с минимальным набором функций стоит 20 долларов, то высококлассные МФД могут стоить от 6 000 долларов и выше.

Монокуляры можно разделить на четыре класса в зависимости от качества и возможностей оптического преобразователя с электронным управлением. Первое и второе можно легко купить на рынке. Третий и четвертый классы состоят из самых современных устройств. Купить их практически невозможно. Причина этого – полный запрет на свободную продажу. Такие монокуляры могут использовать только сотрудники спецслужб. Но даже если гражданскому лицу удастся завладеть монокуляром третьего или четвертого класса, полиция может наложить большой штраф за его использование или хранение.

Наиболее популярными производителями на рынке являются Carl Zeiss, Leica и Minox. Продукцию Sturman не следует воспринимать всерьез, поскольку это любительское оборудование. Отечественные компании также производят монокуляры. Самой популярной компанией является НПЗ, расположенная в Новосибирске. Продукция, представленная этой компанией, характеризуется хорошим соотношением качества и цены.

Что такое монокуляр и для чего он используется

Дмитрий М. 22 сентября 2021 г.

Монокуляр. это небольшой телескоп, оснащенный призматической поворотной системой, или, проще говоря, монокуляр – это половина бинокля. Самой отличительной особенностью монокуляра является его компактность, а размеры и вес не вызывают споров, так как это его главное конкурентное преимущество перед биноклем. Монокуляр имеет размеры, сравнимые с большим пальцем. Бинокль такого размера вряд ли можно найти. Монокуляр легко поместится в бардачке автомобиля, кармане или даже в сумочке. Когда вам нужно что-то посмотреть, вы не будете тратить время на поиски или распаковку.

Как выбрать монокуляр: основные характеристики монокуляров.

Монокуляр можно сравнить с телескопом или маломощным миниатюрным телескопом. Их следует держать как бинокль, но смотреть одним глазом, как в подзорную трубу. Монокуляры технически похожи на телескопы и бинокли, но имеют гораздо меньшие размеры.

Главной отличительной особенностью монокуляра является его компактность, причем размер и вес не подлежат обсуждению, поскольку это его главное конкурентное преимущество перед биноклем. Монокуляр имеет размеры, сравнимые с большим пальцем. Любой из них легко поместится в карман или маленькую сумочку. Монокуляр всегда можно взять с собой на случай, если у вас нет места для телескопа или даже самого компактного бинокля.

Если во время путешествий или даже просто прогулок вы часто ловите себя на мысли о том, как здорово было бы увидеть что-то вдалеке, пора задуматься о покупке монокуляра. Монокуляр также можно использовать как лупу: положите предмет и просто смотрите на него через увеличительное стекло.

Монокуляр по сравнению с биноклем и телескопом.

Теперь перейдем к сути вопроса. Как же понять, что вам нужен именно монокуляр, а не бинокль или телескоп?
Предположим, вы находитесь в ситуации, когда вам необходимо наблюдать за чем-то или смотреть на большую территорию в течение длительного периода времени. Тогда вам лучше выбрать бинокль, потому что бинокль задействует оба глаза, что помогает снизить усталость глаз. Поэтому для серьезных наблюдений, таких как наблюдение за птицами, наблюдение за звездами, охота или шпионаж, бинокль не имеет себе равных.

Охотничьи бинокли

А как насчет телескопа? Если вам нужно большее увеличение, чем у бинокля или монокуляра, вам подойдет телескоп. На первый взгляд, телескоп выглядит как монокуляр и может показаться, что это просто его большой аналог, но на самом деле у них совершенно разные оптические системы. Телескоп очень большой, и часто, особенно при больших увеличениях, его необходимо устанавливать на штатив (который также нужно носить с собой) для обеспечения устойчивости. С другой стороны, монокуляр можно рассматривать в любом положении без необходимости стабилизации и подключать к смартфону для получения более качественных фотографий.

Визуальные телескопы

Каковы же преимущества монокуляров? Это карманный оптический прибор, который не занимает много места. Он пригодится, когда вы не можете носить с собой бинокль или, тем более, телескоп из-за их размеров, когда вам не нужно наблюдать за объектом или местностью в течение длительного времени. Его цель – быть доступным в любое время. Например, если вы слышите пение птиц вдалеке, вы можете достать монокуляр и увидеть певчую птицу за считанные секунды, не распаковывая его, а затем так же быстро убрать! Поэтому решение о выборе типа устройства полностью зависит от ваших целей и намерений.

Теперь перейдем к более подробному анализу характеристик монокуляров.

– Увеличение (первая цифра в названии монокуляра) это характеристика, которая показывает, насколько близко к вам находится объект. Например, в монокуляре 6×15 объекты будут казаться в 6 раз ближе, чем они есть на самом деле. Эта функция часто вызывает недоумение у покупателей. Казалось бы, чем больше число увеличений, тем лучше. На самом деле, необходимо искать золотую середину. Дело в том, что чем выше увеличение оптического прибора, тем сложнее им управлять и тем более требовательны условия эксплуатации. Это в полной мере относится и к такому компактному прибору, как монокуляр. Если вы покупаете монокуляр с увеличением 8х и более, вы столкнетесь с некоторыми проблемами: во-первых, поле зрения такого прибора заметно сужается, а во-вторых, смотреть в него некомфортно из-за дрожания изображения, поскольку приборы с большим увеличением требуют как минимум стабилизации, которая не может быть достаточной для небольшого монокуляра. Вы также можете найти монокуляры с регулируемым увеличением: они полезны в некоторых ситуациях, но менее надежны, чем монокуляры с фиксированным увеличением. Оптимальное увеличение – 5 или 6х: такие устройства имеют оптимальный вес и четко стабилизируют изображение.

– Диаметр объектива (вторая цифра в названии монокуляра) размер передней линзы в миллиметрах. Чем больше объектив, тем больше яркость монокуляра. Однако важно отметить, что большой объективный вход не всегда хорошо, так как увеличение апертуры приводит к увеличению веса монокуляра. Так, монокуляр 10×40 вдвое меньше среднего бинокля, а монокуляр 5×15 – размером с большой палец.

– Поле зрения – это область пространства, видимая через монокуляр. Представьте, что на расстоянии 1 км от вас находится стена: если поле зрения монокуляра 120 м х 1000 м, вы увидите участок этой стены шириной 120 м. Поле зрения – это свойство, обратно пропорциональное увеличению. Чем больше увеличение, тем меньше поле зрения, и наоборот. Если для ваших целей важна ширина поля зрения, лучше выбрать наименьшее допустимое увеличение. Для охоты, например, нужен монокуляр с широким полем зрения, иначе цель вмиг уйдет из кадра. Однако если вы хотите незаметно наблюдать за объектом на расстоянии, лучше выбрать мощный монокуляр с большой апертурой. В некоторых случаях могут быть полезны монокуляры с регулируемым увеличением.

– Расстояние выходного зрачка это расстояние между глазом и окуляром, при котором заданное поле зрения видно полностью и четкость изображения не нарушается. Расстояние выходного зрачка измеряется в миллиметрах. Этот фактор может быть решающим при выборе монокуляра для пользователей очков, поскольку оправа очков не позволяет глазу находиться близко к входной линзе. Если вы собираетесь использовать монокуляр с очками, вам следует обратить внимание на модель с расстоянием между зрачками 14 мм и более.

• Глубина резкости расстояние, которое можно изменить без необходимости настройки фокуса.

• При использовании светосильного объектива необходимо обращать внимание на глубину резкости. Это обработка поверхности линзы для уменьшения отражения света. Он влияет на освещенность изображения, а также на его цветопередачу. Можно выделить три типа покрытия в порядке убывания качества.
1) FMC – оптика с линзами с полным многослойным покрытием. Лучшие монокуляры, как правило, имеют такую функцию.
2) MC – оптики с многослойным покрытием.
3) С – однослойные линзы.

• Заправка газом – Наличие инертного газа (обычно азота или аргона) внутри корпуса. Газ предотвращает образование конденсата и препятствует запотеванию оптики внутри.

• Влагостойкость Способность устройства противостоять проникновению влаги. Имеются два типа, каждый из которых имеет следующие обозначения:
1) WP (водонепроницаемость) -. Полностью водонепроницаемый на глубине до 1 метра в течение 5 минут.
2) WR (Water resist) – гарантирует водонепроницаемость. Это обеспечивает полную водонепроницаемость устройства, устойчивость к брызгам и дождю. Позволяет вести наблюдение в условиях повышенной влажности, но не должен погружаться под воду.

Монокуляр Veber 8×42 WP с компасом и влагозащитой

Мы надеемся, что наша статья была вам полезна и ответила на ваш вопрос.

Полный список различных видов оптики вы можете найти на нашем сайте.

Характеристики монокуляров: сравнение с биноклями и телескопами

Монокуляр можно сравнить с миниатюрным телескопом или маломощным телескопом. Это устройство можно держать в руке как бинокль, но смотреть через него можно одним глазом, как через телескоп. Технические характеристики монокуляра аналогичны биноклям и телескопам, но он имеет гораздо меньшие размеры.

Компактный размер – главная отличительная особенность и конкурентное преимущество монокуляров: некоторые монокуляры не длиннее большого пальца и не толще обычной ручки. Каждый монокуляр легко помещается в карман или небольшую сумочку. Когда нет места для телескопа или даже самого компактного бинокля, вы всегда можете взять с собой монокуляр: сколько ни смотри, трудно найти причину оставить монокуляр дома.

Если вы часто ловите себя на мысли, что неплохо было бы увидеть что-то вдалеке, пора задуматься о покупке монокуляра. Что это на том поле: олень или каменная глыба? – Достаньте из кармана монокуляр и посмотрите на него. Что означает вывеска на третьем этаже торгового центра? – достаньте монокуляр из сумки и посмотрите в него. Монокуляр также можно использовать как лупу: просто положите предмет и посмотрите на него через увеличительное стекло.

Монокуляры в сравнении с биноклями и телескопами

Как узнать, нужен ли вам монокуляр? Когда вам нужен бинокль?

Если у вас много времени для наблюдения или большая территория, которую нужно охватить, лучше использовать бинокль. Бинокль задействует оба глаза, что помогает снизить утомляемость глаз. Поэтому, когда речь идет о серьезных наблюдениях, будь то наблюдение за птицами, звездами, охота, слежка или любой другой сложный процесс, монокуляр не может сравниться с биноклем.

С ним можно пройти там, куда вы никогда не возьмете бинокль. Всегда под рукой – вот для чего он нужен! Представьте себе: если вы слышите пение птиц вдалеке, вы можете увидеть певчую птицу или даже стать свидетелем живого диалога птиц. Мало найдется ситуаций, в которых вы сможете удовлетворить свое любопытство, имея в сумке монокуляр! Так что в споре “бинокль или монокуляр” каждый должен добавить себе очко :).

Что касается телескопа: всегда ли он лучше монокуляра? Если вам нужно большее увеличение, чем у бинокля или монокуляра, решением станет телескоп. На первый взгляд может показаться, что телескоп – это просто большой монокуляр, но на самом деле у них совершенно разные оптические системы. Телескоп громоздок и часто требует установки на штатив для устойчивости, особенно при больших увеличениях. С другой стороны, в монокуляр можно смотреть, встав на цыпочки или выглянув из-за угла! Его можно установить на штатив, подключить к смартфону и делать цифровые фотографии.

Монокулярное увеличение и диаметр объектива

Увеличение (первая цифра в названии монокуляра) – это характеристика, указывающая, насколько близко находится объект. Например, монокуляр 6×15 приближает объекты в 6 раз ближе, чем они есть на самом деле. Казалось бы, чем больше увеличение монокуляра, тем лучше. Но чем выше увеличение любого оптического прибора, тем сложнее им управлять. Это в полной мере относится к такому компактному прибору, как монокуляр.

Увеличение 5x или 6x наиболее подходит для монокуляра: такие приборы имеют оптимальный вес и стабилизацию изображения. При 8x можно получить дрожащее изображение, а поле зрения заметно сужается. Монокуляр с 10-кратным увеличением еще более проблематичен. Вы также найдете монокуляры с регулируемым зумом: они полезны в некоторых ситуациях, но менее надежны, чем монокуляры с фиксированным зумом.

Диаметр объектива (вторая цифра в названии монокуляра) – размер передней линзы в миллиметрах. Чем больше объектив, тем больше яркость монокуляра. Обратите внимание, однако, что большая входная линза не всегда лучше, поскольку увеличение апертуры делает сам монокуляр тяжелее. Приведем несколько примеров: монокуляр 10×40 вдвое меньше среднего бинокля, а монокуляр 5×15 размером с большой палец.

Поле зрения, расстояние до глаза, оптическая четкость и все остальное

Поле зрения – это площадь пространства, видимого через монокуляр. Представьте, что в километре от вас находится забор: если линейное поле зрения монокуляра 113 м на 1000 м, вы увидите участок забора шириной 113 м. Помните, однако, что поле зрения сужается по мере увеличения. Если для ваших целей важна широта, лучше выбрать минимально возможное увеличение. Например, монокуляр для охоты на движущуюся дичь должен иметь широкое поле зрения, иначе “цель” быстро ускользнет из кадра. С другой стороны, если вы хотите наблюдать за целью с большого расстояния, лучше выбрать мощный монокуляр с большим увеличением.

Расстояние выходного зрачка – это расстояние между глазом и окуляром, при котором заданное поле зрения видно полностью и резкость изображения не страдает. Расстояние выходного зрачка измеряется в миллиметрах. Для тех, кто носит очки, это может стать решающим фактором при выборе монокуляра, поскольку оправа окуляра не позволяет глазу приблизиться к входной линзе. Если вы не собираетесь снимать окуляры при ношении монокуляра, ищите модель с расстоянием между зрачками 14 мм. С расстоянием зрачка 14 мм или более..

Глубина резкости – это расстояние, которое вы можете изменить без необходимости перефокусировки.

Освещение Линзы влияют на освещенность изображения и цветопередачу. Лучшие монокуляры имеют оптическую систему с полным многослойным покрытием (FMC), затем следуют те, у которых оптика с многослойным покрытием (MC), затем следуют линзы с одинарным покрытием (C).

Заправка газом– заключается в заполнении герметичного корпуса инертным газом, который предотвращает образование конденсата на внутренних поверхностях оптики.

Если вы планируете использовать монокуляр во время охоты или вблизи водоемов, лучше приобрести водонепроницаемую модель (WP). Однако для домашнего использования эта функция не так важна: простая защита от брызг (WR .).

Как выбрать монокуляр. Популярные монокуляры

Исторически многие из нас больше привыкли к такому типу оптических приборов, как бинокли. И это понятно: у нас два глаза, поэтому назначение монокуляра не совсем понятно. Но в некоторых отношениях он даже более удобен и полезен, чем бинокль. Начнем с того, что у него одна цель – отследить объект. И это не просмотр HDTV, яркость и сочность изображения здесь не играют большой роли. Бинокль имеет преимущество перед монокуляром только в ширине угла зрения, что в монокуляре частично компенсируется поворотом головы. С другой стороны, бинокли также имеют свои весомые преимущества перед монокулярами.

Главное преимущество, и самое очевидное, – это цена. За цену одного бинокля вы можете купить два, но разных монокуляра, предназначенных для разных задач. Их можно комбинировать по мере необходимости. Второе преимущество – компактность, легкость и надежность. Все ясно и понятно: малый вес не отяготит карман, падения не критичны для устройства и т.

д. Наблюдение через монокуляр можно вести скрытно, так как человек в центре города с биноклем в руках привлекает больше внимания. Есть и менее очевидные преимущества. При стрельбе мы целимся одним глазом, и если оружие не оснащено оптическим прицелом, монокуляр позволяет быстро корректировать наши действия при стрельбе. Это также позволяет нам следить за движением объекта, оценивая расстояние до него попеременно вооруженным и невооруженным глазом. Во всем остальном эти два устройства очень похожи, и параметры с качественными характеристиками подойдут как для биноклей, так и для монокуляров. За исключением (по очевидным причинам) монокуляров, параметр межзрачкового расстояния не будет иметь значения.

Давайте кратко рассмотрим основные характеристики, которые необходимо знать при покупке монокуляра.

Увеличение: характеристика, показывающая, насколько близко объект находится к объективу. В описании модели увеличение указывается первой цифрой перед “x”. Для лучшего понимания объясним это на примере монокуляра с десятикратным увеличением (10х).
Когда объект находится на расстоянии ста метров, вы будете видеть его так, как будто он находится на расстоянии десяти метров. Для устройств с переменным фокусным расстоянием цифры будут обозначены тире.
Диаметр объектива (в миллиметрах): это второе число после “x”. Чем больше объектив, тем шире поле зрения.
Прозрачная оптика: стеклянная линза пропускает часть света и отражает часть. В результате не весь свет достигает глаза, и, следовательно, объекты отображаются менее четко. Чтобы исправить этот дефект, линза покрывается одним или несколькими очень тонкими слоями, каждый из которых имеет свою длину волны. Объектив с нанесенной пленкой называется просветленным объективом.
Заполнены азотом или аргоном: эти газы не собирают водяной пар, поэтому линзы не запотевают изнутри при резких изменениях температуры.

Диоптрийная настройка: не у всех хорошее зрение, поэтому многим приходится носить очки, которые часто мешают при использовании монокуляра. Для этого сам окуляр оснащен диоптрийной коррекцией (обычно в пределах ±5D).

На самом деле функций гораздо больше, которые мы частично обсудим в процессе обзора популярных моделей. Выбрать монокуляр на самом деле несложно, но гораздо сложнее решить, для чего он вам нужен, поэтому ниже мы опишем лучшие аппараты в своем классе для каждого типа задач.

Эта модель является отличным примером простого “гражданского” монокуляра. Низкая цена, малый вес и высококачественная оптика сделали его популярным выбором. Его много раз замечали на автобусной остановке, на зрителях на спортивных мероприятиях, реже – в театрах. Этот монокуляр ничем не отличается от других, его главными преимуществами являются светосильная оптика и водонепроницаемый корпус. Весит всего 100 г, поэтому считается “карманной” версией. Кстати, он очень полезен в качестве подарка для студентов и просто хорошего монокуляра для домашнего использования.

Монокуляр КОМЗ МП 15х50 имеет несколько более высокий класс, чем предыдущий, и гораздо больше подходит для активного отдыха. Пресловутый разговор об использовании монокуляра во время охоты будет здесь как нельзя кстати. Во-первых, внешняя ось объектива и ось окуляра разделены, и это сделано не просто так. Это происходит потому, что когда у вас два глаза, вы легко видите центр изображения, но как только вы закрываете один глаз, центр изображения смещается, и вы теряетесь в пространстве. Монокуляр с раздельной осью позволяет расположить линзу как бы между глазами (подобно мифическому циклопу), чтобы изображение, видимое даже одним глазом, было правильно отцентрировано.

Если вам нужно более четкое объяснение того, почему кто-то захочет это сделать, достаточно будет практического примера. При охоте на водоплавающую дичь, например, возникает ситуация, когда подстреленная утка улетает в заросли камыша. Поскольку пейзаж в камышах ужасно однообразен, вам необходимо знать точное направление, в котором упала утка. Малейшее отклонение от правого центра склона – и поиск утки будет продолжаться долгое время. Да, это хорошо, если у вас есть охотничья собака и зрение вас не подводит, но если нет? Вот где пригодится КОМЗ МФ.

Помимо прочего, этот монокуляр интересен тем, что производится в нашей стране, что само по себе редкость. Это один из немногих вариантов, где материал корпуса – металл, а не пластик. Хорошо это или плохо, сразу ответить нельзя, вероятно, для каждого это что-то свое. Излишне говорить, что монокуляр оснащен просветленной оптикой и имеет реальное угловое поле зрения 4,4°. Он все еще недорогой, но уже имеет достаточно высокое качество.

Yukon NVMT Spartan 2×24 (ночное видение, $190).

Этот монокуляр даже не монокуляр, а скорее прибор ночного видения, выполненный в виде монокуляра. Мы не будем долго объяснять назначение этого устройства – все понятно из названия. Но мы расскажем вам, насколько качественно все реализовано. Помните, что Yukon в мире оптических приборов можно сравнить с BMW в мире автомобилей. Здесь у нас есть свои “Мерседесы” и “Бентли”, но Юкон есть Юкон. Все традиционно выполнено по самым высоким стандартам: прорезиненный корпус с мягким покрытием, продуманные крепления для штатива или шлема.

Ночное видение основано на инфракрасной подсветке и работает на расстоянии до 150 метров. Однако самое лучшее в этом монокуляре то, что для него можно приобрести специальные фотоадаптеры, чтобы он мог также стать объективом фотокамеры. Возможность использования монокуляра с камерой выводит его на совершенно новый уровень, а перспективы ночной фото- и видеосъемки трудно переоценить. Сейчас существует множество любительских камер с функцией ночной съемки, но диапазон зума у них совсем другой, и возможность снимать даже при дневном свете с расстояния 200 метров будет очень полезна.

Minox MD 6×16 A ($250)

Minox MD 6×16 A – один из лучших туристических монокуляров. Если мы говорим о туристических, то, честно говоря, мы не всегда знаем, какой это тип и в чем разница между туристическим и охотничьим, например. Но, тем не менее, разница есть. Охотник создан для неприхотливости, его можно уронить, утопить, испачкать и т.д. Охотники, как правило, сильные мужчины, для которых лишний килограмм веса не имеет особого значения.

Турист – это птица другого рода. Для туриста битва за вес багажа может вестись за граммы, ценятся универсальные вещи. Сами туристы ведут себя более спокойно, чем охотники, часто склонны наблюдать и вести записи. Именно для этого и создана туристическая оптика.

Minox MD 6×16 A не является выдающимся оптически, он имеет достойные параметры, вполне типичные для приборов этого класса. Преимущество устройства заключается в другом. Бар, высотомер, термометр, часы и секундомер “встроены” в металлический (!) корпус, очень компактный и необычный для оптики. Dipol D126H Pro – отличный выбор для альпинистов, тренеров по всем видам стрельбы и зимних видов спорта.

Dipol D126H Pro ($2150)

Абсолютно “хардкорная” версия, напоминающая нам о том, что создание современных монокуляров – это в первую очередь военная инициатива. При создании этой модели целью было не столько создать облегченную версию бинокля, сколько сделать устройство, подходящее для прицелов, прицельных модулей, осветителей и фотографического оборудования.

Целые комплексы под названием “день-ночь” особенно популярны в тактических маневрах. Это монокуляры, которые можно мгновенно прикрепить к другому устройству или даже перевернуть. Требования, предъявляемые к оборудованию военного или, так сказать, оружейного характера, очень высоки.

Рассматриваемый монокуляр является одной из таких бескомпромиссных систем. Это также прибор ночного видения с хорошим диапазоном инфракрасной подсветки и, более того, возможностью подключения дополнительного инфракрасного модуля для усиления эффекта. Корпус не вызывает никаких нареканий, поскольку здесь применены все средства защиты от влаги, пыли и грязи. Сама оптика выполнена по самым высоким стандартам, это “дальнобойное оружие” с дальностью наблюдения 500 метров. В общем, не все смогут оценить это устройство, круче будет только телескоп.

Вместо заключения

Из описания большинства монокуляров может сложиться впечатление, что бинокль вообще не нужен. Умелое использование одного или двух монокуляров решит задачи наблюдения не хуже, а то и лучше, чем бинокль, причем приборы первой категории имеют более низкую цену и более прочные компактные корпуса.

Промышленность может предложить выбор монокуляров практически для любых целей, но качество оптики было и будет оставаться главным критерием выбора. Это альфа и омега любого оптического устройства. Высококачественную оптику можно узнать по характерным разноцветным слепкам, ощущению глубины и многослойности линз, и даже физически – вес высококачественного объектива тяжелый. Корпус такой линзы может быть изготовлен из самых разных материалов, но он должен быть абсолютно без люфта, трещин, следов клея и даже царапин. И самым опасным фактором риска для любого оптического устройства является перегрев.

Читайте далее:

Значение слова; монокль.
Абажур для сауны и парилки.
Как увеличить комнату: выбор цвета, мебели, оформление стен, потолков и полов.
Способы подключения датчиков движения к светодиодным прожекторам.
Схема подключения детектора движения с освещением.
Дизайн маленькой комнаты (200 фото): идеальное оформление, выбор цвета и стиля, планирование и зонирование.

как выбрать монокуляр для рыбалки

>>>ПЕРЕЙТИ НА ОФИЦИАЛЬНЫЙ САЙТ >>>

Оглавление

Что такое как выбрать монокуляр для рыбалки?
Эффект от применения
Мнение специалиста
Как заказать?
Отзывы покупателей

Что такое как выбрать монокуляр для рыбалки?

Отличная вещь! Качество на уровне! Прорезиненная,вид респектабельный. Качество оптики отличное. Приближает отлично. Доволен приобретением. Отечественный монокль за 4500 не даёт такого результата. Спасибо!

Эффект от применения как выбрать монокуляр для рыбалки

Монокуляр Bushnell 16×52 имеет ряд неоспоримых преимуществ по сравнению с аналогами. Устройство для наблюдения и приближения функционирует по принципу бинокля, только с одним окуляром. Учитывая, что приспособление становится компактнее и удобнее в транспортировке – это вряд ли можно отнести к минусам.

Мнение специалиста

Монокуляр Bushnell 16×52 относится к современной технологически обновленной категории приспособлений для дальнего наблюдения. Среди конкурентов рассматриваемая модель выделяется оригинальным дизайном, высококачественными комплектующими деталями и внедрением инновационных технологий при изготовлении. Подобное устройство может применяться в качестве аксессуара для активного отдыха, охоты или повседневного наблюдения, например, на стройке.

Как заказать

Для того чтобы оформить заказ как выбрать монокуляр для рыбалки необходимо оставить свои контактные данные на сайте. В течение 15 минут оператор свяжется с вами. Уточнит у вас все детали и мы отправим ваш заказ. Через 3-10 дней вы получите посылку и оплатите её при получении.

Отзывы покупателей:

Nika

Мужу на день рождения друзья подарили монокуляр. Муж остался очень доволен. Из за прорезиненного корпуса очень хорошая защита от ударов и влаги. Обьектив достаточно большой. Передает точные картинки. Оптика стеклянная а не платиковая, через него все видно.

Вика

Купил монокуляр для поездок на охоту и рыбалку. Есть регулировка дальности, качество сборки отличное. Видно через монокуляр отлично. Видны все мелкие предметы, отлично подходит для охоты. Вес незначительный. Очень хороший монокуляр, советую купить.

>>>ПЕРЕЙТИ НА ОФИЦИАЛЬНЫЙ САЙТ >>>

Покупал для охоты, не прогадал. Начну сразу с преимуществ, замеченных мною, в отличие от моего прошлого монокуляра, этот гораздо легче, что важно, ведь вещей на вылазки и так не мало приходится брать. Приближает хорошо, компактный, корпус сделан из качественного, не дешёвого материала. Ещё Bushnell 16×52 не скользит в руках, прочный, стекло оптики не царапается. Цена для такого полезного прибора — приемлемая. Где купить как выбрать монокуляр для рыбалки? Монокуляр Bushnell 16×52 относится к современной технологически обновленной категории приспособлений для дальнего наблюдения. Среди конкурентов рассматриваемая модель выделяется оригинальным дизайном, высококачественными комплектующими деталями и внедрением инновационных технологий при изготовлении. Подобное устройство может применяться в качестве аксессуара для активного отдыха, охоты или повседневного наблюдения, например, на стройке.
Как выбрать монокуляр по основным характеристикам. Чтобы разобраться, какой монокуляр выбрать, необходимо рассмотреть базовые характеристики оптических приборов этого типа. В результате вы самостоятельно сможете определить, устройство с каким набором параметров стоит. Перед тем, как выбрать монокуляр, нужно выделить основные его характеристики, на которые и обращалось внимание при . Подходит такой монокуляр для охоты, похода в театр и спортивных мероприятий. Диаметр объектива составляет 30 мм. Оптика имеет многослойное просветляющее покрытие. Несмотря на бюджетность монокуляра, пользователи выбирают его за удобство в применении и транспортировке . Устройство одинаково работоспособно при использовании как для охоты или рыбалки, так и внутри закрытых пространств. Обрезиненный корпус легко помещается в руке, не скользит, не. Рейтинг лучших монокуляров: как выбрать хороший, отзывы, цены. Монокуляр сравнивается с маломощным телескопом или . Его часто используют для охоты и рыбалки. Конструкция позволяет быстро выследить зверя и контролировать вокруг него всю территорию. Подробный рейтинг лучших монокуляров. И выбирая половинку от бинокля (монокуляр) за те же деньги что и бинокль. Вы не получите в два раза лучшее качество. . Подводя итог можно сказать: Для рыбалки и любительских целей, вполне достаточно и бюджетных приборов. Если вы хотите выбрать хороший монокуляр для рыбалки или охоты, то изучите наш рейтинг, в который вошли 7 лучших моделей этого года. . Монокуляр — удобный оптический прибор, который сравнивают с портативным телескопом. Существуют модели не больше шариковой ручки. Какой лучший монокуляр выбрать для охоты и города по отзывам и соотношению цена/качество? Ответ в нашем рейтинге- топ 10 самых лучших монокуляров 2020! Вне зависимости от вида активного отдыха — охота, рыбалка или туристический поход — качественная оптика всегда будет полезна. Наиболее очевидное и привычное решение для охотника — использование бинокля. Критерии выбора монокуляра схожи с правилами для биноклей. О том, как выбрать бинокль можно почитать здесь. . Карманная модель для охоты, для рыбалки, прогулок и путешествий. Величина укрупнения восьмикратная, а диаметр оптики — 42 мм. Минимальное расстояние фокусировки.
https://ccestrategica.com/files/slova_iz_slova_monokuliar1830.xml
http://дши-элегия.рф/upload/monokuliar_16x52_66m_8000m5977.xml
http://www.euro-plast.biz.pl/galeria/file/otzyvy_o_monokuliare_navigator8099.xml
http://stabiactiv.com/userfiles/monokuliar_sturman_8x216759.xml
http://www. lemonsport.at/upload/chem_otlichaetsia_monokuliar_ot_binoklia6392.xml
Монокуляр Bushnell 16×52 имеет ряд неоспоримых преимуществ по сравнению с аналогами. Устройство для наблюдения и приближения функционирует по принципу бинокля, только с одним окуляром. Учитывая, что приспособление становится компактнее и удобнее в транспортировке – это вряд ли можно отнести к минусам.
как выбрать монокуляр для рыбалки
Отличная вещь! Качество на уровне! Прорезиненная,вид респектабельный. Качество оптики отличное. Приближает отлично. Доволен приобретением. Отечественный монокль за 4500 не даёт такого результата. Спасибо!
Монокуляр – оптический прибор. По сути – это половина бинокля, сохранившая все его свойства. Обычно устройство используют на рыбалке, охоте, в походах. Большое количество моделей различных производителей представлены в. Промокод ALIKOPOLD — скидка 150 ₽ от 1000 ₽. Виртуальная китайская площадка представляет колоссальный ассортимент разных товаров. Можно найти даже такие специфические изделия, как рефракторный телескоп. Покупайте монокуляры со скидками на AliExpress. Увидели что-то, что вам очень понравилось? Теперь можно купить это, воспользовавшись выгодными предложениями на AliExpress! Просто просмотрите большой ассортимент монокуляры и отфильтруйте по критерию наиболее. Место. Наименование. Характеристика в рейтинге. Лучшие монокуляры с переменной кратностью (с зумом) с АлиЭкспресс. 1. GOMU 10-30х50. Мощный водонепроницаемый прибор с переменной кратностью. 2. Nikula 10-30×25. Три режима работы. Лучшее увеличение. 3. Среди оптических приборов, которые позволяют успешно вести наблюдение за объектом, большой популярностью пользуются монокуляры. Они выигрывают компактностью, удобством в использовании и очень выгодной ценой. На Алиэкспресс можно купить недорогой телескоп или монокуляр. Выбор здесь весьма неплохой. Давайте рассмотрим ТОП-10 телескопов (монокуляров) с Алиэкспресс. В этой подборке вы увидите лучшие телескопы и монокуляры по цене и качеству на. Оцените лучшие ТОП 5 монокуляров, которые без труда можно купить на Алиэкспресс в 2021 году. . Подбирая такой товар, рекомендуется обратить внимание на лучшие монокуляры с АлиЭкспресс в 2020 году. Один из лучших недорогих — цифровой монокуляр Wildgameplus WG535/WG532/WG540 со встроенным ночным зрением. Параметры оптического монокуляра: 5X40, до 200 метров. Инфракрасная CMOS матрица (5Мп) обеспечивает работу на 850 нм, в том числе с активной лазерной. Выбираем лучший монокуляр с АлиЭкспресс: топ лучших моделей. Содержание. Как выбрать и купить монокуляр на Алиэкспресс? . Рейтинг монокуляров. Что нужно знать перед покупкой монокуляра? Лучшие недорогие монокуляры. Лучшие монокуляры с Алиэкспресс в 2021. Долженко Александр Витальевич. Большой любитель охоты и рыбалки. . Это самый недорогой из всего рейтинга монокуляров с алиэкспресс, но занимает первые места по популярности. Прибор маленький, 11 см длинной и 100 грамм. Лучшие монокуляры на Алиэкспресс — Топ — 5 товаров. Как купить монокуляр на сайте Алиэкспресс? ⏩ Покупая прибор, нужно ознакомиться с основными техническими характеристиками. Лучшие монокуляры по отзывам. Рейтинг 2021-2020. Что лучше бинокль или монокуляр? . 7. Challenger GS 2.7×50. Лучшие монокуляры с Алиэкспресс. ТОП 10. . Если же требуется приобрести недорогой прибор для быстрого обнаружения объекта и с возможностью его перемещения в кармане сумки. 5 лучших монокуляров с AliExpress. Монокуляры широко используются на охоте, во время путешествий, наблюдения за птицами и животными, во время осмотра соревнований спортивного плана и в военных целях. Только официальная фото- и видеотехника. Гарантия производителя. Доставка. Акции. · Надёжный магазин. Большой ассортимент. Профессиональные камеры. Доставка по России · Продавец: Pixel24.ru. Адрес: Россия, Москва, Б…

Монокль 3

В процессе развития, в ответ на раздражители и на протяжении всей жизни клетки переход из одного функционального «состояния» в другое. Клетки в разных состояниях экспрессируют различные наборы генов, производя динамический набор белков и метаболиты, выполняющие свою работу. Когда клетки перемещаются между состояниями, они подвергаются процесс реконфигурации транскрипции, при котором некоторые гены замолкают и другие недавно активированы. Эти переходные состояния часто трудно охарактеризовать. потому что очистка клеток между более стабильными конечными состояниями может быть затруднена или невозможно. Одноклеточная РНК-Seq может позволить вам увидеть эти состояния без потребность в очищении. Однако для этого мы должны определить, где каждая ячейка находится в диапазоне возможных состояний.

Monocle представила стратегию использования RNA-Seq для анализа траектории одиночных клеток . Вместо того, чтобы очищать клетки до дискретных состояний экспериментально Монокль использует алгоритм для изучения последовательности генов изменения экспрессии, через которые должна пройти каждая клетка как часть динамического биологического процесс. Как только он изучит общую «траекторию» экспрессии генов изменения, Монокль может поместить каждую ячейку в правильное положение на траектории. Затем вы можете использовать набор инструментов дифференциального анализа Monocle, чтобы найти гены, регулируемые по ходу траектории, как описано в разделе Поиск генов, изменяющихся в зависимости от псевдовремени. Если есть несколько исходов процесса, Монокль реконструирует «разветвленный» траектория. Эти ветки соответствуют клеточным «решениям», а Монокль предоставляет мощные инструменты для выявления затронутых ими генов и задействованных в их изготовлении. Посмотреть, как анализировать ветки, можно в разделе Анализ ветвей в одноклеточных траекториях.

Рабочий процесс реконструкции траекторий очень похож на рабочий процесс кластеризации, но имеет несколько дополнительных особенностей. шаги. Чтобы проиллюстрировать рабочий процесс, мы будем использовать другой набор данных C. elegans, этот из Пакер и Чжу и др. Их исследование включает анализ временных рядов всего развивающиеся эмбрионы. Мы рассмотрим небольшое подмножество данных, которое включает большинство нейронов. Мы будем загружать его, как мы сделал с данными L2:

 expression_matrix <- readRDS(url("https://depts.washington.edu:/trapnell-lab/software/monocle3/celegans/data/packer_embryo_expression.rds"))
cell_metadata <- readRDS(url("https://depts.washington.edu:/trapnell-lab/software/monocle3/celegans/data/packer_embryo_colData.rds"))
Gene_annotation <- readRDS(url("https://depts.washington.edu:/trapnell-lab/software/monocle3/celegans/data/packer_embryo_rowData.rds"))
cds <- new_cell_data_set(expression_matrix,
                         ячейка_метаданные = ячейка_метаданные,
                         ген_метаданные = ген_аннотация)

Предварительная обработка данных

Предварительная обработка работает точно так же, как и кластерный анализ. На этот раз мы будем использовать другую стратегию пакетной коррекции, которая включает в себя то, что сделали Пакер и Чжу и др. в своем первоначальном анализе:

Примечание. В ваших данных не будет показанной здесь информации о пакете загрузки, вы исправите пакет, используя свой собственный пакет. информация.

 cds <- preprocess_cds (cds, num_dim = 50)
cds <- align_cds(cds, Alignment_Group = "партия", остаточная_модель_формула_str = "~ bg.300.loading + bg.400.loading + bg.500.1.loading + bg.500.2.loading + bg.r17.loading + bg.b01 .загрузка + bg.b02.загрузка")

Обратите внимание, что в дополнение к использованию аргумента alignment_group для align_cds() , который выравнивает группы ячеек (т. Этот аргумент предназначен для вычитания непрерывных эффектов. Вы можете использовать это для управления такими вещами, как доля митохондриальных прочтений в каждой клетке, которая иногда используется в качестве метрики контроля качества для каждой клетки. В этом эксперименте (как и во многих экспериментах с scRNA-seq) некоторые клетки спонтанно лизируются, высвобождая свои мРНК в клеточную суспензию непосредственно перед загрузкой в препарат библиотеки одиночных клеток. Эта «супернатантная РНК» в определенной степени загрязняет профиль транскриптома каждой клетки. К счастью, довольно просто оценить уровень фонового загрязнения в каждой партии клеток и вычесть его, что и сделали Пакер и др. в исходном исследовании. Каждая из колонок bg.300.loading , bg.400.loading , соответствует фоновому сигналу, которым может быть загрязнена ячейка. Передача этих столбцов в качестве членов в остаточном_модели_формулы_стр сообщает align_cds() о необходимости вычитания этих сигналов перед уменьшением размерности, кластеризацией и выводом траектории. Обратите внимание, что вы можете вызвать align_cds() с помощью alignment_group , остаточного_модели_формулы или обоих.

Уменьшение размерности и визуализация результатов

Далее мы уменьшаем размерность данных. Однако, в отличие от кластеризации, которая хорошо работает как с UMAP, так и с t-SNE, здесь мы настоятельно рекомендуем вам использовать UMAP, метод по умолчанию:

 cds <- уменьшить_размер(cds)
plot_cells(cds, label_groups_by_cluster=FALSE, color_cells_by = "cell. type")

Как видите, несмотря на то, что мы рассматриваем только небольшой фрагмент этого набора данных, Monocle реконструирует траектория с многочисленными ответвлениями. Наложение ручных аннотаций на UMAP показывает, что эти ветви в основном заняты одним типом клеток.

Как и в случае с кластерным анализом, вы можете использовать plot_cells() , чтобы визуализировать, как отдельные гены изменяются по траектория. Давайте посмотрим на некоторые гены с интересными паттернами экспрессии в реснитчатых нейронах:

 ciliated_genes <- c("che-1",
                    "хлх-17",
                    "НХР-6",
                    "ДМД-6",
                    "Чех-36",
                    "ветчина-1")
plot_cells (диски,
           гены=реснитчатые_гены,
           label_cell_groups = ЛОЖЬ,
           show_trajectory_graph=ЛОЖЬ)

Мы узнаем, как идентифицировать гены, которые ограничены каждым исходом траектории, позже в разделе Поиск генов, изменяющихся в зависимости от псевдовремени.

Сгруппируйте свои ячейки

Хотя клетки могут непрерывно переходить из одного состояния в другое без дискретной границы между ними, Монокль не предполагает, что все клетки в наборе данных происходят от общего транскрипционного «предка». Во многих экспериментах, на самом деле может быть несколько различных траекторий. Например, в ткани, реагирующей на инфекцию, ткань резидентные иммунные клетки и стромальные клетки будут иметь очень разные начальные транскриптомы и будут реагировать на инфекцию. совершенно по-разному, поэтому они должны быть частью одной и той же траектории.

Монокль может узнать, когда клетки должны быть размещены на одной и той же траектории, а не на разных траекториях через процедуры его кластеризации. Напомним, что мы запускаем cluster_cells() , каждая ячейка присваивается не только кластеру но и на раздел. Когда вы изучаете траектории, каждый раздел со временем станет отдельным траектория. Мы запускаем cluster_cells() , как и раньше.

 cds <- cluster_cells(cds)
plot_cells(cds, color_cells_by = "раздел")

Изучите график траектории

Далее мы подгоним основной граф к каждому разделу, используя функцию Learn_graph() :

 cds <-learn_graph(cds)
plot_cells (диски,
           color_cells_by = "ячейка.тип",
           label_groups_by_cluster = ЛОЖЬ,
           label_leaves=ЛОЖЬ,
           label_branch_points=FALSE)

Этот график будет использоваться во многих последующих шагах, таких как анализ ветвей и дифференциальное выражение.

Заказать ячейки в псевдовремени

Как только мы выучили график, мы готовы упорядочить клетки в соответствии с их продвижением по пути развития. программа. Монокль измеряет этот прогресс в псевдовремени. Поле ниже определяет псевдовремя.

Чтобы расставить клетки по порядку, нам нужно сказать Моноклю, где находится «начало» биологического процесса. мы делаем так путем выбора областей графа, которые мы помечаем как «корни» траектории. В экспериментах с временными рядами это обычно может быть достигнуто путем нахождения мест в пространстве UMAP, которые заняты ячейками из ранних моментов времени:

 plot_cells(cds,
           color_cells_by = "эмбрион.время.бин",
           label_cell_groups = ЛОЖЬ,
           label_leaves = ИСТИНА,
           label_branch_points = ИСТИНА,
           graph_label_size=1.5)

Черные линии показывают структуру графика. Обратите внимание, что граф не полностью связан: ячейки в разных разделах находятся в разных компонентах графа. Кружки с цифрами в них обозначают особые точки на графике. Каждый лист, обозначенный светло-серыми кружками, соответствует другому исходу (то есть судьбе клетки) траектории. Черные кружки обозначают узлы ветвления, в которых клетки могут перейти к одному из нескольких исходов. Вы можете контролировать, будет ли они показаны на графике с label_leaves и label_branch_points аргументы для plot_cells . Обратите внимание, что цифры в кружках приведены только для справки.

Теперь, когда у нас есть представление о том, куда попадают ранние ячейки, мы можем вызвать order_cells() , который рассчитает, где каждая ячейка попадает в псевдовремя. Для этого order_cells() необходимо, чтобы вы указали корневые узлы графа траектории. Если вы не предоставите их в качестве аргумента, он запустит графический пользовательский интерфейс для выбора один или несколько корневых узлов.

 cds <- order_cells(cds)

В приведенном выше примере мы выбрали только одно местоположение, но вы можете выбрать любое количество. Нанесение ячеек и раскрашивание их по псевдовремени показывает, как они были упорядочены:

 plot_cells(cds,
           color_cells_by = "псевдовремя",
           label_cell_groups = ЛОЖЬ,
           label_leaves=ЛОЖЬ,
           label_branch_points = ЛОЖЬ,
           graph_label_size=1. 5)

Обратите внимание, что некоторые ячейки окрашены в серый цвет. Это означает, что у них бесконечное псевдовремя, потому что они недоступны. из выбранных корневых узлов. Как правило, любой ячейке в разделе, в котором отсутствует корневой узел, будет присвоен бесконечный псевдовремя. Как правило, вы должны выбрать по крайней мере один корень на раздел.

Часто желательно указать корень траектории программно, а не выбирать его вручную. Функция ниже делает это, сначала группируя ячейки в соответствии с тем, к какому узлу графа траектории они ближе всего. Затем он вычисляет какая часть ячеек в каждом узле относится к самой ранней точке времени. Затем он выбирает наиболее загруженный узел. ранними ячейками и возвращает это как корень.

 # вспомогательная функция для определения корневых основных точек:
get_earliest_principal_node <- function(cds, time_bin="130-170"){
  cell_ids <- which(colData(cds)[ "embryo. time.bin"] == time_bin)
  
  ближайшая_вершина <-
  cds@principal_graph_aux[["UMAP"]]$pr_graph_cell_proj_closest_vertex
  ближайшая_вершина <- as.matrix(ближайшая_вершина[имена столбцов(cds),])
  root_pr_nodes <-
  igraph::V(principal_graph(cds)[["UMAP"]])$name[as.numeric(имена
  (который.max(таблица(ближайшая_вершина[cell_ids,]))))]
  
  root_pr_nodes
}
cds <- order_cells(cds, root_pr_nodes=get_earliest_principal_node(cds))

Передача программно выбранного корневого узла в order_cells() через аргумент root_pr_node дает:

 plot_cells(cds,
           color_cells_by = "псевдовремя",
           label_cell_groups = ЛОЖЬ,
           label_leaves=ЛОЖЬ,
           label_branch_points = ЛОЖЬ,
           graph_label_size=1.5)

Обратите внимание, что мы могли бы легко сделать это для каждого раздела, сначала сгруппировав ячейки по разделам. используя перегородки () функция. Это приведет к тому, что всем ячейкам будет присвоено конечное псевдовремя.

Подмножество ячеек по филиалам

Часто полезно разделить ячейки на подмножества на основе их ветвей на траектории. Функция Choose_graph_segments позволяет сделать это в интерактивном режиме.

 cds_sub <- Choose_graph_segments(cds)

Работа с 3D траекториями

 cds_3d <-reduce_dimension(cds, max_components = 3)
cds_3d <- cluster_cells(cds_3d)
cds_3d <-learn_graph(cds_3d)
cds_3d <- order_cells (cds_3d, root_pr_nodes = get_earliest_principal_node (cds))
cds_3d_plot_obj <- plot_cells_3d(cds_3d, color_cells_by="partition")

ПредыдущийСледующий

Построение траекторий с помощью Monocle 3 • Signac

Установить
Новости
Начать
Часто задаваемые вопросы
Виньетки
Ссылка
Архив
Обсуждения

Составлено: 07 декабря 2022 г.

Источник: виньетки/монокль.Rmd

monocle.Rmd

В этой виньетке мы покажем, как строить траектории клеток с помощью Monocle 3, используя данные ATAC-seq для отдельных клеток. Информацию об установке Monocle 3 см. на веб-сайте Monocle 3.

Чтобы облегчить преобразование между форматами Seurat (используется Signac) и CellDataSet (используется Monocle 3), мы будем использовать функцию преобразования в пакете SeuratWrappers, доступном на GitHub.

Загрузка данных

Мы будем использовать набор данных ATAC-seq для отдельных клеток, содержащий человеческие CD34+ гемопоэтические стволовые клетки и клетки-предшественники, опубликованный Satpathy and Granja et al. (2019, Природная биотехнология).

Обработанный набор данных доступен на NCBI GEO здесь: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE129785

Обратите внимание, что файл фрагмента находится внутри GSE129785_RAW. Архив .tar , индекс файла фрагмента не указан. Вы можете сами проиндексировать файл с помощью tabix, например: tabix -p bed .

Сначала мы загрузим набор данных и выполним стандартную предварительную обработку с помощью Signac.

 библиотека (Синьяк)
библиотека (Сера)
библиотека (SeuratWrappers)
библиотека(монокль3)
библиотека (матрица)
библиотека (ggplot2)
библиотека (пэчворк)
set.seed(1234)

 путь к файлу <- "../vignette_data/GSE129785/GSE129785_scATAC-Hematopoiesis-CD34"
пики <- read.table (paste0 (путь к файлу, ".peaks.txt.gz"), заголовок = ИСТИНА)
ячейки <- read.table (paste0 (путь к файлу, ".cell_barcodes.txt.gz"), заголовок = TRUE, stringsAsFactors = FALSE)
имена строк (ячейки) <- make.unique (ячейки $ штрих-коды)
mtx <- readMM(file = paste0(filepath, ".mtx"))
mtx <- as(object = mtx, Class = "dgCMatrix")

 ## as(, "dgCMatrix") устарело, начиная с Matrix 1.5-0; вместо этого сделайте as(., "CsparseMatrix")

 colnames(mtx) <- rownames(cells)
rownames(mtx) <-peaks$Feature

bone_assay <- CreateChromatinAssay(
  количество = мтх,
  мин. ячеек = 5,
  фрагменты = "../vignette_data/GSE129785/GSM3722029_CD34_Progenitors_Rep1_fragments.tsv.gz",
  сэп = с("_", "_"),
  геном = "hg19"
)
кость <- CreateSeuratObject(
  количество = кость_анализ,
  мета.данные = ячейки,
  анализ = "ATAC"
)
# Набор данных содержит несколько типов ячеек
# Мы можем включить в подмножество только одну реплику клеток-предшественников CD34+
кость <- кость[ кость$Group_Barcode == "CD34_Progenitors_Rep1"]
# добавить аннотации типов ячеек из оригинальной статьи
cluster_names <- c("HSC", "MEP", "CMP-BMP", "LMPP", "CLP", "Pro-B", "Pre-B", "GMP",
                  «МДП», «пДК», «кДК», «Моноцит-1», «Моноцит-2», «Наивный-Б», «Память-Б»,
                  «Плазмоциты», «Базофилы», «Незрелые-NK», «Зрелые-NK1», «Зрелые-NK2», «Наивные-CD4-T1»,
                  «Наивный-CD4-T2», «Наивный-Treg», «Память-CD4-T», «Treg», «Наивный-CD8-T1», «Наивный-CD8-T2»,
                  «Наивный CD8-T3», «Центральная память-CD8-T», «Эффекторная память-CD8-T», «Гамма-дельта T»)
num. labels <- длина (названия_кластеров)
имена (имена_кластеров) <- paste0 ( rep («Кластер», num.labels), seq (num.labels))
кость $celltype <- cluster_names[as.character(bone$Clusters)]
кость[["ATAC"]]

 ## Данные ChromatinAssay с 570650 признаками для 9913 клеток
## Характеристики переменных: 0
## Геном: hg19
## Присутствует аннотация: FALSE
## Присутствующие мотивы: FALSE
## Файлы фрагментов: 1

Далее мы можем добавить к объекту аннотации генов для генома hg19. Это будет полезно для вычисления показателей контроля качества (показатель обогащения TSS) и построения графиков.

 библиотека (EnsDb.Hsapiens.v75)
# извлечь аннотации генов из EnsDb
аннотации <- GetGRangesFromEnsDb(ensdb = EnsDb.Hsapiens.v75)
# изменить стиль на UCSC, так как данные были сопоставлены с hg19seqlevelsStyle(аннотации) <- 'UCSC'
# добавить информацию о гене к объекту
Аннотация (кость) <- аннотации

Контроль качества

Мы рассчитаем обогащение TSS, показатель нуклеосомного сигнала и процент количества в областях геномного черного списка для каждой клетки и используем эти показатели, чтобы помочь удалить клетки низкого качества из наборов данных.

 кость <- TSSEnrichment(кость)
кость <- NucleosomeSignal(кость)
кость $ blacklist_fraction <- FractionCountsInRegion (кость, регионы = blacklist_hg19)

 ВлнПлот(
  объект = кость,
  features = c("nCount_ATAC", "TSS.enrichment", "nucleosome_signal", "blacklist_fraction"),
  пт.размер = 0,1,
  nкол = 4
)

 кость <- кость [ (bone$nCount_ATAC < 50000) &
               (кость $TSS.обогащение > 2) и
               (bone$nucleosome_signal < 5)]

Предварительная обработка набора данных

Затем мы можем запустить стандартный конвейер анализа scATAC-seq, используя Signac, чтобы выполнить уменьшение размеров, кластеризацию и аннотацию типов ячеек.

 кость <- FindTopFeatures(кость, min.cells = 10)
кость <- RunTFIDF(кость)
кость <- RunSVD(кость, n = 100)
DepthCor(кость)

 кость <- RunUMAP(
  кость,
  сокращение = "lsi",
  димс = 2:50,
  сокращение.имя = "УМАП"
)

 кость <- FindNeighbors(кость, размерность = 2:50, уменьшение = "lsi")
кость <- FindClusters(кость, разрешение = 0,8, алгоритм = 3)

 ## Оптимизатор модульности, версия 1. 3.0, Людо Уолтман и Нис Ян ван Экк
##
## Количество узлов: 9765
## Количество ребер: 433498
##
## Запуск алгоритма умного локального перемещения...
## Максимальная модульность в 10 случайных запусках: 0,8474
## Количество сообществ: 18
## Прошедшее время: 5 секунд

 DimPlot(bone, label = TRUE) + NoLegend()

Назначьте каждому кластеру наиболее распространенный тип ячеек на основе исходных аннотаций из статьи.

 for(i в уровнях(кости)) {
  Cells_to_reid <- WhichCells(кость, идентификаторы = i)
  newid <- имена (сортировка (таблица (кость $ тип клетки [cells_to_reid]), уменьшение = ИСТИНА)) [1]
  Иденты (кость, ячейки = ячейки_to_reid) <- newid
}
Bone$assigned_celltype <- Idents(кость)

 DimPlot(кость, метка = TRUE)

Далее мы можем подмножить различные линии и создать траекторию для каждой линии. Другой способ построить траектории — использовать весь набор данных и построить отдельные псевдовременные траектории для различных сегментов ячеек, найденных Monocle 3.

 DefaultAssay(bone) <- "ATAC"
эритроидный <- кость [ тип кости $assigned_celltype %in% c("HSC", "MEP", "CMP-BMP")]
лимфоидная <- кость [ тип кости $assigned_cell %in% c("HSC", "LMPP", "GMP", "CLP", "Pro-B", "pDC", "MDP", "GMP")]

Построение траекторий с помощью Monocle 3

Мы можем преобразовать объект Seurat в объект CellDataSet с помощью функции as.cell_data_set() из SeuratWrappers и построить траектории с помощью Monocle 3. Мы сделаем это отдельно для эритроидных и лимфоидных клонов, но вы можете изучить и другие стратегии. построение траектории для всех родословных вместе.

 erythroid.cds <- as.cell_data_set(эритроид)
erythroid.cds <- cluster_cells(cds = erythroid.cds, reduce_method = "UMAP")
erythroid.cds <-learn_graph(erythroid.cds, use_partition = TRUE)
лимфоид.cds <- as.cell_data_set(лимфоид)
лимфоид.cds <- cluster_cells(cds = лимфоид.cds, reduce_method = "UMAP")
лимфоид.cds <-learn_graph(lymphoid.cds, use_partition = TRUE)

Чтобы вычислить оценки псевдовремени для каждой траектории, нам нужно решить, каково начало каждой траектории. В нашем случае мы знаем, что гемопоэтические стволовые клетки являются предшественниками других типов клеток на траектории, поэтому мы можем установить эти клетки в качестве корня траектории. Monocle 3 включает интерактивную функцию для выбора ячеек в качестве корневых узлов в графе. Эта функция будет запущена при вызове order_cells() без указания параметра root_cells . Здесь мы предварительно выбрали несколько ячеек в качестве корневых и сохранили их в файл для воспроизводимости. Этот файл можно скачать здесь.

 # загрузить предварительно выбранные HSC
hsc <- readLines("../vignette_data/hsc_cells.txt")

 # ячейки заказа
erythroid.cds <- order_cells(erythroid.cds, reduce_method = "UMAP", root_cells = hsc)
лимфоид.cds <- order_cells(lymphoid.cds, reduce_method = "UMAP", root_cells = hsc)
# построение траекторий, окрашенных псевдовременем
plot_cells(
  cds = эритроид.cds,
  color_cells_by = "псевдовремя",
  show_trajectory_graph = ИСТИНА
)

 plot_cells(
  cds = лимфоид. cds,
  color_cells_by = "псевдовремя",
  show_trajectory_graph = ИСТИНА
)

Извлеките значения псевдовремени и добавьте к объекту Сера

 кость <- AddMetaData(
  объект = кость,
  метаданные = erythroid.cds@principal_graph_aux@listData$UMAP$псевдовремя,
  col.name = "Эритроид"
)
кость <- AddMetaData(
  объект = кость,
  метаданные = лимфоид.cds@principal_graph_aux@listData$UMAP$псевдовремя,
  col.name = "Лимфоид"
)

 FeaturePlot(кость, c("Эритроид", "Лимфоид"), pt.size = 0.1) & scale_color_viridis_c()

Благодарности

Спасибо разработчикам Monocle 3, особенно Коулу Трапнеллу, Ханне Плинер и сотрудникам лаборатории Трапнелла. Если вы используете Monocle, укажите документы Monocle.

Информация о сеансе

 информация о сеансе ()

 ## R версия 4.1.3 (10 марта 2022 г.)
## Платформа: x86_64-pc-linux-gnu (64-разрядная версия)
## Запуск под: Ubuntu 20.04.5 LTS
##
## Матричные продукты: по умолчанию
## BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas. so.3.9.0
## LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.9.0
##
## локаль:
## [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
## [3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
## [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
## [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
## [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
## [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
##
## прикрепленные базовые пакеты:
## [1] stats4 stats graphics grDevices использует методы наборов данных
## [8] база
##
## другие прикрепленные пакеты:
## [1] EnsDb.Hsapiens.v75_2.99.0 ансамбльb_2.18.2
## [3] AnnotationFilter_1.18.0 GenomicFeatures_1.46.1
## [5] АннотацияDbi_1.56.2 patchwork_1.1.2
## [7] ggplot2_3.4.0 Matrix_1.5-3
## [9] monocle3_1.2.9 SingleCellExperiment_1.16.0
## [11] Суммарный эксперимент_1.24.0 GenomicRanges_1.46.1
## [13] GenomeInfoDb_1.30.1 IRanges_2.28.0
## [15] S4Vectors_0.32.4 MatrixGenerics_1.6.0
## [17] matrixStats_0.62.0 Biobase_2.54.0
## [19] BiocGenerics_0.40.0 SeuratWrappers_0.3.0
## [21] SeuratObject_4. 1.3 Seurat_4.2.1
## [23] Синьяк_1.9.0
##
## загружается через пространство имен (и не прикрепляется):
## [1] rappdirs_0.3.3 rtracklayer_1.54.0 scattermore_0.8
## [4] R.methodsS3_1.8.2 ragg_1.2.4 tidyr_1.2.1
## [7] бит64_4.0.5 вязанр_1.40 ирлба_2.3.5.1
## [10] DelayedArray_0.20.0 R.utils_2.12.2 data.table_1.14.6
## [13] rpart_4.1.16 KEGGREST_1.34.0 RCurl_1.98-1,9
## [16] generics_0.1.3 terra_1.6-17 leidenbase_0.1.12
## [19] cowplot_1.1.1 RSQLite_2.2.18 RANN_2.6.1
## [22] proxy_0.4-27 future_1.29.0 bit_4.0.4
## [25] spatstat.data_3.0-0 xml2_1.3.3 httpuv_1.6.6
## [28] assertthat_0.2.1 viridis_0.6.2 xfun_0.35
## [31] hms_1.1.2 jquerylib_0.1.4 Assessment_0.18
## [34] promises_1.2.0.1 fansi_1.0.3 restfulr_0.0.15
## [37] progress_1.2.2 dbplyr_2.2.1 igraph_1.3.5
## [40] DBI_1.1.3 htmlwidgets_1.5.4 spatstat.geom_3.0-3
## [43] purrr_0.3.5 ellipsis_0.3.2 backports_1.4.1
## [46] dplyr_1.0.10 biomaRt_2.50.0 deldir_1.0-6
## [49] vctrs_0.5.1 remotes_2.4.2 ROCR_1.0-11
## [52] связать_1.4-5 cachem_1.0.6 с r_2. 5.0
## [55] BSgenome_1.62.0 progressr_0.11.0 мат_2.1.0
## [58] sctransform_0.3.5 GenomicAlignments_1.30.0 prettyunits_1.1.1
## [61] goftest_1.2-3 cluster_2.1.3 lazyeval_0.2.2
## [64] crayon_1.5.2 spatstat.explore_3.0-5 labeling_0.4.2
## [67] pkgconfig_2.0.3 vipor_0.4.5 nlme_3.1-160
## [70] ProtGenerics_1.26.0 nnet_7.3-17 rlang_1.0.6
## [73] globals_0.16.2 lifecycle_1.0.3 miniUI_0.1.1.1
## [76] filelock_1.0.2 BiocFileCache_2.2.0 rsvd_1.0.5
## [79] дихромат_2.0-0.1 ggrastr_1.0.1 rprojroot_2.0.3
## [82] polyclip_1.10-4 lmtest_0.9-40 boot_1.3-28
## [85] zoo_1.8-11 beeswarm_0.4.0 base64enc_0.1-3
## [88] ggridges_0.5.3 png_0.1-7 viridisLite_0.4.1
## [91] rjson_0.2.21 битопс_1.0-7 R.oo_1.25.0
## [94] KernSmooth_2.23-20 Biostrings_2.62.0 blob_1.2.2
## [97] stringr_1.4.1 parallel_1.32.1 spatstat.random_3.0-1
## [100] jpeg_0.1-9 scales_1.2.1 memoise_2.0.1
## [103] magrittr_2.0.3 plyr_1.8.8 ica_1.0-3
## [106] zlibbioc_1.40.0 компилятор_4.1.3 BiocIO_1.4.0
## [109] RColorBrewer_1.1-3 lme4_1.1-31 fitdistrplus_1. 1-8
## [112] Rsamtools_2.10.0 cli_3.4.1 XVector_0.34.0
## [115] listenv_0.8.0 pbapply_1.6-0 htmlTable_2.4.1
## [118] Formula_1.2-4 MASS_7.3-56 tidyselect_1.2.0
## [121] stringi_1.7.8 textshaping_0.3.6 highr_0.9## [124] yaml_2.3.6 решеткаExtra_0.6-30 ggrepel_0.9.1
## [127] grid_4.1.3 VariantAnnotation_1.40.0 sass_0.4.2
## [130] fastmatch_1.1-3 tools_4.1.3 future.apply_1.10.0
## [133] parallel_4.1.3 rstudioapi_0.14 Foreign_0.8-82
## [136] gridExtra_2.3 farver_2.1.1 Rtsne_0.16
## [139] дайджест_0.6.30 BiocManager_1.30.19 блестящий_1.7.3
## [142] Rcpp_1.0.9Later_1.3.0 RcppAnnoy_0.0.20
## [145] httr_1.4.4 biovizBase_1.42.0 colorspace_2.0-3
## [148] XML_3.99-0.12 fs_1.5.2 tensor_1.5
## [151] reticulate_1.26 splines_4.1.3 uwot_0.1.14
## [154] RcppRoll_0.3.0 spatstat.utils_3.0-1 pkgdown_2.0.6
## [157] sp_1.5-1 plotly_4.10.1 systemfonts_1.0.4
## [160] xtable_1.8-4 jsonlite_1.8.3 nloptr_2.0.3
## [163] R6_2.5.1 Hmisc_4.7-1 столб_1.8.1
## [166] htmltools_0.5.3 mime_0.12 Glue_1.6.2
## [169] fastmap_1.